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PacBio全长转录组

转录组研究是理解生物机体功能的一个重要途径。传统二代转录组测序无法直接获得单个RNA分子由5ˊ到3ˊ的全部序列。基于PacBio三代测序平台的转录组研究,无需打断,直接读取反转录的全长cDNA,能够有效的获取高质量的单个RNA分子的全部序列,准确辨别二代测序无法识别的同源异构体(isoform)、同源基因、超家族基因或等位基因表达的转录本。

  

对于人类以及动植物样本,转录本长度分布会存在一定差异,一般情况下建议构建四个不同长度的文库:1.0-2.0Kb;2.0-3.0Kb;3.0-6.0Kb;>6.0Kb,然后针对每个文库,建议至少测序2个SMRT Cell的数据量;如需获得较为全面的isoform信息,则建议至少测序8个SMRT Cell的数据量进行分析。



技术优势

1. 直接测序即可获得全长转录组序列信息,one read=one full lengh transcript;

2. 转录本序列无需拼接;

3. 获得全面的可变剪切、融合基因以及Isoform信息。



结果展示

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